会计科目是将全部资金来源与资金运用，按不同经济成份、行业、资金性质和核算要求进行分类设置的名称。它是设置帐户和确定报表项目的依据，会计科目在银行会计核算中占有重要地位。

(一)会计科目的管理审计

    会计科目的设置必须体现金融方针政策，适应国民经济管理体制，便于银行经营管理和会计核算。审计时，一是审查各行、处是否按总行统一规定设置的会计科目执行，分行以下行、处有无任意设置会计科目的问题。二是审查各行、处在年度终了新旧科目结转时，是否采用了对照表方式办理结转，在年度中间，是否一律采取填制传票，通过分录的结转办法进行。

(二)会计科目的使用审计

    会计科目的经济内容是会计对象的具体体现，由于人民银行和各专业银行各项资金的经济内容要求不尽相同，各行会计科目的分类也有所不同，各级行、处对各总行所规定的会计科目必须正确地加以使用。一是按经济成份进行审查。银行现行设置的会计科目，是按国民经济不同部门并结合本身业务内容的特点进行分类，审查各级行、处各开户单位是否正确地使用会计科目。二是按不同的行业进行审查。不同行业具有不同的经济内容。银行对各行各业应采用不同的会计科目，以反映各该行业的性质。三是按资金性质进行审查。银行的资金可分为资金来源、资金运用和资金来源与资金运用共同类。对会计科目的设置和使用是否正确反映其资金性质从而进行正确的分类。四是对表外科目使用的审查。表外科目是用来核算业务已经发生而尚未涉及资金增减变化，或不涉及资金增减变化的业务事项，是对有份单证、重要凭证、实物的控制。查看各行、处是否采用单式记帐，发生记收入，销减记付出，余额反映在收方，有无定期核对，账实是否相符。